一般应由组织关系现所在党组织办理转正手续。

因为档案缺少内容，本科学校一直没有接收档案，说明组织关系没有转接，仍在专科院校，你应当在专科院校转正，提前向本科院校说明情况，这是符合规定的。转正之后再转接组织关系。

建议向本科学校党组织申请办理“延长考察期半年”。

预备党员预备期满后，应及时转正。对超过规定审批期限的，要分不同的情况区别对待。因党员组织关系结转等客观原因造成的转正延误，可申请支部复议。
1、超过规定期限3个月内的，要及时向所在党支部说明原因，因党员关系结转程序或上级党组织工作上的原因拖延了审批时间，预备党员具备党员条件的，应按期转正。
2、超过规定期限较长时间的，须申请支部大会复议。经复议认为确实具备党员条件的，应决定其从预备期满之日起按期转正。
3、超过期间转正需要上级党组织审批。超过规定期限较长时间的，由支部复议后再报上级党组织审批，同意转为正式党员的，其转正时间按支部复议后形成支部大会决议的时间计算。
建议尽快与专科学校和本科学校进行沟通和协调。明确档案缺失的具体内容，以及补全档案的具体时间和方式。向所在党支部说明原因，并尽快提交转正申请。

据表述情况，建议向本科学校党组织申请办理“延长考察期半年”，期满后再办理转正

《新编发展党员工作手册》（党建读物出版社2023年9月）第116页，“因特殊情况，不能按时提出转正申请的，应当在其预备期满后1个月之内向向党组织提出书面转正申请。”第119页，“在没有特殊情况下，党支部一般应当在收到预备党员转正申请1个月内召开党员大会讨论其转正问题，遇特殊情况最长不超过3个月。”
1.联系专科学校党组织，开一份为何组织关系没有按时转过来的函、一份介绍你在预备期间的现实情况的函。

2.本人有没有在预备期满前一周内向组织关系所在党组织递交按期转正申请（转正申请书）。如没有，向党支部递交转正申请。写之前，应问清楚所在支部的要求（字数等等）。

3.如果支部不接受你的转正申请，你就将你的情况以书面材料向党支部汇报（说明为什么党员组织关系转这么晚错过预备期满的时间），党支部不受理就向学院党组织汇报。逐级反映，不能越级汇报！
4.态度要诚恳，现在不是争论业务的时候，是解决问题的时候！

5.召开转正大会的时间≠成为正式党员的时间。假如你是3月10号入党，次年3月20号开会，党员大会通过你按期转正的申请，那么你成为正式党员的时间是3月10号而非3月20号。

6.你这种情况，不能在专科的党组织转正。因为从2023年9月起，你的学习单位是现在的本科学校。

我附两个文稿供你参考，不一定准确。括号里面的是说明，记得删掉：


中共××委员会（本科二级学院党组织）：

预备党员×，×年×月入党，入党介绍人×、×。×年×月，×毕业升学，党员组织关系应及时转到你处。

因与你处党员档案归档要求不一致、业务不熟悉等，××所在党支部将×党员档案进行补充，故×党员组织关系未及时转到你处。

特此函告。

中共××委员会：

××，男，×族，×年×月出生，×年×月在××大学××学院加入中国共产党。

××入党以来，认真学习马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观，学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想，思想端正，工作积极，学习刻苦，表现良好。

特此函告。

根据问题，依照《中国共产党发展党员工作细则》中关于预备党员转正的规定，预备期满应书面向党组织递交转正申请的，递交转正申请后再与学校党组织联系和沟通。

可以在专科学校继续转正啊，由于档案缺少材料需要原专科学校党组织补充说明，无法正常转入到本科学校组织关系，请本科学校党组织出具您在入学后至今的现实表现证明材料，交给专科学校作为转正的参考依据，尽快完成转正，这个不应视为异地入党的。

这种因补齐档案材料导致的时间延误，不应一刀切不予转正。毕竟党员本人没有做错什么。