要搞明白这个问题，其实是需要理解好《中国共产党党和国家机关基层组织工作条例》第三十三、第三十四、第三十七条的条款：

第三十三条  机关党建工作在各级党委领导下，由同级党的机关工作委员会统一领导、单位党组（党委）具体领导和管理，有关部门各负其责、密切配合，形成合力。
  
第三十四条  党的机关工作委员会统一领导所属机关党的工作，指导督促各单位党组（党委）落实机关党建主体责任。

第三十七条  机关党的基层委员会审批预备党员或者预备党员转正，应当提前报党组（党委）讨论决定。机关不设党的基层委员会的总支部委员会、支部委员会接收预备党员或者讨论预备党员转正，应当经党组（党委）审核把关后，报党的机关工作委员会审批。

以您所说市委来分析，机关党建工作（包括发展党员）管理层级为：

市委（派出→）市直属机关工作委员会（统一领导→）各单位党组或党委（具体领导和管理→）单位下属部门党组织

而下属部门党组织可能有3种情况：
【1】一般是100名党员以上成立党的基层委员会（简称党委）
【2】50—100人，成立党总支
【3】3人以上，成立党支部

如果，您的工作岗位在，*市*局*处*科，那么就要看*处，是①党委还是；②党支部（党总支）

①如果*处是党委（党的基层委员会）：*科党员大会决议并提交请示，*处党委审批前，报*局党组（党委）讨论决定，*处党委收到批复再进行审批。

②如果*处是党支部（党总支）：*科党小组提交请示，*处党支部报*局党组（党委）审核把关，*局党组（党委）报*市直属机关党工委审批。

感谢您的问题，自己查了一通，试做回答，也基本明白了。

虽然《发展党员工作细则》第二十三条规定党组不能审批预备党员，但《党组工作条例》第十八条规定党组有讨论和决定基层党组织设置调整和发展党员、处分党员重要事项的职责。《党和国家机关基层组织工作条例》第二十七条也有规定：机关党的基层委员会审批预备党员或者预备党员转正，应当提前报党组（党委）讨论决定。机关不设党的基层委员会的总支部委员会、支部委员会接收预备党员或者讨论预备党员转正，应当经党组（党委）审核把关后，报党的机关工作委员会审批。
可见，无论是市直单位的机关党委自行审批，还是报市直机关工委审批，只要本单位有党组（党组性质的党委）或者接受某党组（党组性质的党委）领导，都需要该党组（党组性质的党委）进行前置审核。
党组（党组性质的党委）虽然不能直接审批预备党员，但党组（党组性质的党委）不同意的话，机关党委（市直机关工委）不能进行讨论审批。

你的理解是准确的。

《中国共产党党和国家机关基层组织工作条例》第三十七条第一款：机关党的基层委员会审批预备党员或者预备党员转正，应当提前报党组(党委)讨论决定。机关不设党的基层委员会的总支部委员会、支部委员会接收预备党员或者讨论预备党员转正，应当经党组(党委)审核把关后，报党的机关工作委员会审批。
请按照上述规定执行预备党员的接收和转正。

根据《中国共产党党和国家机关基层组织工作条例》的规定，机关党的基层委员会审批预备党员或者预备党员转正，应当提前报党组或党组性质党委讨论决定。机关不设党的基层委员会的总支部委员会、支部委员会接收预备党员或者讨论预备党员转正，应当经党组或党组性质党委审核把关后，报党的机关工作委员会审批。