网络党支部是个新事物，目前都是有想法，没有实践，随着时代的发展，科技的进步，建议可以创新尝试，做第一个吃螃蟹的人。
按照老人老办法，新人新办法来说，你的发展程序是合法合规的，发展结果也是有效的，不应该断章取义的就断定你为非法发展，因此个人认为，原发展组织出具相关证明或者说明即可认定为中共党员。
专题组织生活会是根据本单位的实际情况进行的一种自我设置的主题生活会，属于民主生活会的延伸，但是也是民主生活会的基本表现形式之一。专题需要单位自定主题，可结合近期单位发生的重大事件，重要安排等内容确定主题。
根据有关规定，党员志愿书的编号是从2017年开始在全国推行的，不能据此认定他的党员身份有问题，入党志愿书就是党员身份的证明，不知道你说的证明材料指的是什么？有些单位可能不会将政审的材料放进档案里。如果真的有疑问，建议向入党组织所在地发函请求证明。
首先你们召开的应该是党员大会而不是党员代表大会，这样这个会议才能有效；其次党组织的设置可以由上级党委决定成立也可以有党支部向上级请示成立，结合你们的实际情况，建议由党委研究决定成立，然后进行选举支部班子即可，但是要做好向上级党委备案工作。
工会补助和困难党员补助属于两种补助，一个是工会组织的，一个是党内关怀，没有冲突，可以接受。
不是党员不能在民主生活会上开展批评和自我批评，但是可以列席会议，这种情况限于是领导干部的党员，如果是普通群众，可以邀请列席组织生活会，但是不能发言，不能表态，没有投票权利。
成立党支部是根据实际需要成立的，特别是在国有单位，要应建尽建，但是要建立一个成熟一个，而不是为了建而建。首先，成立党支部无可厚非，但是并不是说明确组织机构、党员均在3名以上的情况下就要马上成立党支部，成立党支部有一定的程序和规程，既要考虑实际情况又要考虑工作需要。二是党委书记已经明确了部门领导班子没有配齐，说明成立的时机还不够成熟，从长远来看，成立临时党支部或者成立党支部筹备工作组都是合适的，彰显了领导的长远考虑。三成立党支部是为了服务中心工作，起政治核心作用，上级党委具有管理权限，作为一名党员服从上级决议，听从上级安排是正确的，但是可以保留申诉的权利，有权向上一级党委反映情况，督促尽快成立党支部。
先解决组织问题，在讨论开会问题，你们只有三个人，按理说只能成立党小组或者临时党支部，不具有开民主生活会的条件。
