党员大会和主题党日，只是覆盖的范畴不同。
《中国共产党支部工作条例（试行）》第十一条　党支部党员大会是党支部的议事决策机构，由全体党员参加，一般每季度召开1次。
党支部党员大会的职权是：听取和审查党支部委员会的工作报告;按照规定开展党支部选举工作，推荐出席上级党代表大会的代表候选人，选举出席上级党代表大会的代表;讨论和表决接收预备党员和预备党员转正、延长预备期或者取消预备党员资格;讨论决定对党员的表彰表扬、组织处置和纪律处分;决定其他重要事项。党员大会除上党课外，主要是讨论研究其职权范围内的重大工作，决定根本性、方向性的事项，属于民主议事的范畴。
第十六条，党支部每月相对固定1天开展主题党日，组织党员集中学习、过组织生活、进行民主议事和志愿服务等。这是为党支部开展各类组织生活固定了一个日期，或者是平台，还包括召开支委会、党小组会、志愿服务、交纳党费、开展批评与自我批评等。那么上党课和进行民主议事是主题党日的一小部分内容，党员大会和主题党日不是割裂的两项组织生活制度，而是对党支部组织生活的不同表述。可以理解为在主题党日这一天，开展包括党员大会在内的“三会一课”、志愿服务、收缴党费等工作。

主题党日与组织生活的关系： 如果从形式上讲，可以打个比方：主题党日是个“筐”，“三会一课”等组织生活可以往里面“装”。
设立主题党日的目的，主要是“每月相对固定1天”开展党的各种组织生活，并给这些组织生活一个明确的主题。“三会一课”作为组织生活的具体形式，可以纳入主题党日的活动内容。

党员大会和主题党日可以一起开，记录建议分开。

党员大会和主题党日可以一起开。
党员大会和主题党日分开记录。

可以。
分开记录。

根据问题，结合实际的支部工作，主题党日可以以支部大会的形式召开，在具体记录时，只要在记录里注明主题党日即可。

可以放到同一天，也可以一起开，但会议议程要分开，并且记录要分开记录，因为“三会一课”和主题党日都属于党内组织生活制度。