与上级党组织沟通，上级党组织根据实际情况可以直接任命。

是有违法犯罪还是有违规违纪？是身体不适还是有其他原因？性质不同流程也是不同的~

由本支部酝酿候选人，向上级党组织打报告，申请召开支部大会进行选举，也可有上级直接任命。

向上级党组织请示，说明原因。
非换届期间，有必要时上级党组织可以直接指定支部负责人。

根据你所述情况和有关规定，建议由上级党委直接任免支部书记。

　　党支部书记的流程是上报党委进行选举，也可以上级党委直接任命，只要是用于选举权的正式党员都可以竞选，列入候选人，开会表决，会后结果上报上级党委。
　　按照《中国共产党支部工作条例（试行）》参考。
　　第二十三条　党支部书记应当具备良好政治素质，热爱党的工作，具有一定的政策理论水平、组织协调能力和群众工作本领，敢于担当、乐于奉献，带头发挥先锋模范作用，在党员、群众中有较高威信，一般应当具有1年以上党龄。
　　第二十四条　上级党组织应当结合不同领域实际，突出政治标准，按照组织程序，采取多种方式，选拔符合条件的优秀党员担任党支部书记。
　　村、社区应当注重从带富能力强的村民、复员退伍军人、经商务工人员、乡村教师、乡村医生、社会工作者、大学生村官、退休干部职工等群体中选拔党支部书记。对没有合适人选的，上级党组织可以跨地域或者从机关和企事业单位选派党支部书记。根据工作需要，上级党组织可以选派优秀干部到村、社区担任党支部第一书记，指导、帮助党支部书记开展工作，主要承担建强党支部、推动中心工作、为民办事服务、提升治理水平等职责任务。符合条件的村、社区党支部书记可以通过法定程序担任村民委员会、居民委员会主任。
　　机关、国有企业、事业单位，党支部书记一般由本部门本单位主要负责人担任，也可以由本部门本单位其他负责人担任。根据工作需要，上级党组织可以选派党员干部担任专职党支部书记。
　　非公有制经济组织、社会组织，一般从管理层中选任党支部书记，应当注重从业务骨干中选拔党支部书记。没有合适人选的，可以由上级党组织选派党支部书记。