表述过于简单。你是不是想问张三从列为入党积极分子到被接收为预备党员的时间未达一年以上的规定时限，他的党员身份是否可以承认？请问，他目前转为正式党员了吗？情况不明，所以难以解答。
从理论上说，只要这名中层干部的组织关系转到了另一个部门的党组织了，他是可以担任另一个部门党组织书记的，但在实践中，一般不这样配备党组织书记，因为这样不利于工作的开展。如果另一个部门暂时无合适人选，可由上级领导班子中的一名党员成员或有上级党组织领导班子中的一名成员兼任。供你参考。
第一，“入党名额”的提法不妥，建议改为“发展党员计划数”；第二，发展党员计划应按党组织的隶属关系制订。以上系我个人理解，供你参考。
所述内容过于简单，“2011年5月提交转正申请，被同意转为正式党员。”是指支部同意转为正式党员还是指具有审批权限的党委（工委）同意转为正式党员呢？
特指由本党组织发展的预备党员。（不包括当年转入的由其他党组织发展的预备党员）
建议你参考《基层党组织选举工作实用手册》（中共中央党校出版社）第三篇所述内容办理。
设立党组的部门和单位，可以建立某某党组理论学习中心组。具体可依照中共中央办公厅印发的《中国共产党党委（党组）理论学习中心组学习规则》执行。
似乎没有统一的党员联系服务群众制度的文稿，还得由你结合实际拟订。
按月领取工资的党员交纳党费的计算基数：
按月领取工资的党员主要包括党政机关、人民团体、各类企业事业单位中按月领取工资的党员，也包括各类非公有制经济组织、社会组织中按月领取工资的党员。
按月领取工资的党员交纳党费的基数包括：机关工作人员（不含工人）的职务工资、级别工资、津贴补贴；事业单位工作人员的岗位工资、薪级工资、绩效工资、津贴补贴；机关工人的岗位工资、技术等级（职务）工资、津贴补贴；企业人员工资收入中的固定部分（基本工资、岗位工资）和活的部分（奖金）。列入交纳党费计算基数的津贴补贴是指：根据国家关于规范津贴补贴的有关规定，对各地各单位干部职工普遍发放的规范津贴补贴（工作性津贴和生活性补贴）。
党费计算基数不包括以下项目：个人所得税，养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险、住房公积金（含个人和单位缴纳部分），职业年金、企业年金，住房补贴、交通补贴、公务用车补贴、通讯补贴、加班补贴、误餐补贴、取暖费、防暑降温费、物业费等改革性补贴，以及针对少数地区、部分单位、特殊岗位、部分人员发放的津贴补贴。（比如，艰苦边远地区津贴，法院检察院办案津贴、审计补贴、纪检监察办案人员补贴、公安值勤岗位津贴、密码人员岗位津贴、信访岗位津贴、有突出贡献专家享受的政府特殊津贴等。对一些未提到的津贴、补贴项目是否可作为党费计算基数不包括项目，由基层党委根据中央组织部有关规定精神研究确定）
————摘自《基层党务工作实用手册》（党建读物出版社）
按月领取工资的党员主要包括党政机关、人民团体、各类企业事业单位中按月领取工资的党员，也包括各类非公有制经济组织、社会组织中按月领取工资的党员。
按月领取工资的党员交纳党费的基数包括：机关工作人员（不含工人）的职务工资、级别工资、津贴补贴；事业单位工作人员的岗位工资、薪级工资、绩效工资、津贴补贴；机关工人的岗位工资、技术等级（职务）工资、津贴补贴；企业人员工资收入中的固定部分（基本工资、岗位工资）和活的部分（奖金）。列入交纳党费计算基数的津贴补贴是指：根据国家关于规范津贴补贴的有关规定，对各地各单位干部职工普遍发放的规范津贴补贴（工作性津贴和生活性补贴）。
党费计算基数不包括以下项目：个人所得税，养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险、住房公积金（含个人和单位缴纳部分），职业年金、企业年金，住房补贴、交通补贴、公务用车补贴、通讯补贴、加班补贴、误餐补贴、取暖费、防暑降温费、物业费等改革性补贴，以及针对少数地区、部分单位、特殊岗位、部分人员发放的津贴补贴。（比如，艰苦边远地区津贴，法院检察院办案津贴、审计补贴、纪检监察办案人员补贴、公安值勤岗位津贴、密码人员岗位津贴、信访岗位津贴、有突出贡献专家享受的政府特殊津贴等。对一些未提到的津贴、补贴项目是否可作为党费计算基数不包括项目，由基层党委根据中央组织部有关规定精神研究确定）
————摘自《基层党务工作实用手册》（党建读物出版社）
根据你所述情况，应将其所有相关材料转至其现在工作单位党组织，再由其现工作单位党组织负责办理相关手续。
