延长预备期经过支部研究后报上级党委审批。
《中国共产党发展党员工作细则》第三十二条：“需要继续考察和教育的，可以延长一次预备期，延长时间不能少于半年，最长不超过一年；不履行党员义务、不具备党员条件的，应当取消其预备党员资格。” “预备党员违犯党纪，情节较轻，尚可保留预备党员资格的，应当对其进行批评教育或延长预备期；情节较重的，应当取消其预备党员资格。”

纪律处分的种类有：警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍。
预备党员延长预备期并不属于纪律处分。

预备党员预备期满后，仍不完全具备党员条件时，要延长预备期，继续对其进行教育和考察。一般对以下几种情况的预备党员应该延长预备期：
①入党时不完全具备党员条件，在预备期进步不大，但本人愿意继续锻炼提高，经过培养教育，可能较快达到党员标准的；
②预备期间，在思想、工作、学习等方面出现一些缺点毛病，在群众中造成不良影响，但经组织指出后愿意改正的；
③预备期间犯了一般性错误，虽有检查认识，但需要继续教育和考察的；
④入党前犯有较严重错误，入党时隐瞒，入党后很快主动交待，认识深刻，并在预备期间表现很好，党组织根据其错误性质的情况，经认真讨论，认为可留在党内继续考察教育的；
⑤工作积极，不怕困难，开拓进取，并做出一定成绩，但是思想作风上存在骄傲自满、强迫命令、脱离群众等严重的缺点，经教育愿意改正的；
⑥入党时基本不具备党员条件，但又没有严重错误，入党后有明显进步，虽然尚未达到党员标准，但经过教育可以较快具备党员条件的；
⑦有其它情况影响预备党员转正，党组织认为需要继续教育和考察的。

需要注意的是：预备期满后，对不具备党员条件的预备党员，应及时召开党支部 大会讨论，作出延长预备期或取消预备党员资格的决议，并报上级党 组织批准。

所以决定预备党员是否延长预备期应由党支部召开支部大会进行讨论并报上级党组织批准，而纪检部门是不能决定的，但是纪检部门是可以向党支部提出相关建议。